На Луне «Люди в Черном» совместно с правительством Соединенных Штатов соорудили тюрьму, куда отправляют наиболее опасных инопланетян вроде «Бориса Животного». В 1969-ом году последний сошелся в бою с молодым агентом Кейем и лишился одной руки. Заодно Земля получила энергетический шит под названием «Аркнет», предотвративший нашествие боглодитов, космических паразитов, нацеленных на пожирание других видов. От голода раса вымерла, а единственный представитель озлобился до предела. Впрочем, среди землян нашлась чокнутая дамочка, наладившая переписку с подобным отродьем. Она добивается свидания с кавалером, притаскивая тортик с сюрпризом. Внутри сидит симбионт, стреляющий острыми и прочными шипами. Охрана не замечает замаскированное существо, что приводит к катастрофическим последствиям.
Борис сбегает, перемещается в прошлое и расправляется с Кейем. Агент Джей расследует деятельность Джеффри Прайса выяснив, именно этот беспринципный преступник продал «Животному» миниатюрную машину времени. Никто про прославленного ветерана не помнит, а поскольку «Аркнет» не установлен, боглодиты вторгаются на планету и приступают к поглощению биомассы. Главный герой вынужден прыгнуть с высотного здания, чтобы набрать достаточную скорость и переместиться в 1969-ый. США готовятся отправить Нила Армстронга в космос, а решающее сражение должно состояться именно на пусковой площадке «Аполлона», долетевшего до Луны.